20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1808 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  31.49 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  29.19 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  28.42 
 
 		 199 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  29.73 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  26.11 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  26.67 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  26.74 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  26.01 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  26.59 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  25.43 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  26.01 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  25.56 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  27.64 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  35.56 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  25.86 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  31.17 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>