291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1760 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  71.23 
 
 
247 aa  308  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  68.56 
 
 
254 aa  308  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  68.78 
 
 
249 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  66.67 
 
 
251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  66.08 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  66.52 
 
 
250 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  66.52 
 
 
250 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  66.23 
 
 
250 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  71.04 
 
 
252 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  65.49 
 
 
249 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  69.68 
 
 
251 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  69.55 
 
 
247 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  66.81 
 
 
251 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  67.54 
 
 
255 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  69.09 
 
 
247 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  64.44 
 
 
251 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  64.44 
 
 
251 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  64.95 
 
 
271 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  65.16 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  69.01 
 
 
251 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  69.01 
 
 
251 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  69.01 
 
 
251 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  65.61 
 
 
263 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  67.84 
 
 
253 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  69.63 
 
 
253 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  65.89 
 
 
251 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  66.36 
 
 
267 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  68.78 
 
 
248 aa  274  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  65.42 
 
 
251 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  64.65 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  67.44 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  60.17 
 
 
258 aa  272  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2551  integral membrane protein TerC  68.84 
 
 
257 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767156  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1566  integral membrane protein TerC  68.64 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.22924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  62.9 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4488  Integral membrane protein TerC  63.8 
 
 
250 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4942  Integral membrane protein TerC  70.7 
 
 
252 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  67.87 
 
 
246 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  62.27 
 
 
259 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1673  Integral membrane protein TerC  69.16 
 
 
248 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295174  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1845  Integral membrane protein TerC  69.48 
 
 
248 aa  258  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  53.39 
 
 
522 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  53.39 
 
 
518 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  50.67 
 
 
242 aa  238  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4110  integral membrane protein TerC  68.69 
 
 
256 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  46.5 
 
 
518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  47.56 
 
 
514 aa  231  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  49.34 
 
 
523 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  53.39 
 
 
522 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
523 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  46.31 
 
 
522 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  47.13 
 
 
522 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.75 
 
 
519 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.75 
 
 
519 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  46.75 
 
 
519 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  46.75 
 
 
519 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  46.75 
 
 
519 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.15 
 
 
516 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  47.15 
 
 
518 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.46 
 
 
523 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  48.46 
 
 
523 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  52.68 
 
 
252 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  49.55 
 
 
529 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
527 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  48.31 
 
 
510 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  49.78 
 
 
518 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  51.38 
 
 
253 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.58 
 
 
239 aa  223  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  49.14 
 
 
253 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  52.02 
 
 
238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  47.51 
 
 
529 aa  221  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  45.68 
 
 
518 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1494  hypothetical protein  51.32 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  48.65 
 
 
528 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  50.86 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  46.91 
 
 
517 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1489  hypothetical protein  51.32 
 
 
243 aa  218  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  49.1 
 
 
577 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  49.59 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  49.1 
 
 
515 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  48.02 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  50.68 
 
 
249 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  49.1 
 
 
515 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  45.42 
 
 
518 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  45.12 
 
 
517 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  49.55 
 
 
238 aa  214  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  52.94 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  48.85 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  49.13 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  49.11 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  48 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>