More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1757 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 235 aa  480  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  65.75 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  66.06 
 
 		 231 aa  315  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  65 
 
 		 229 aa  314  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  58.06 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  56.77 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  54.3 
 
 		 232 aa  275  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  57.66 
 
 		 232 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  57.08 
 
 		 230 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  55.31 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  56.64 
 
 		 231 aa  269  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  58.77 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  56.62 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  56.76 
 
 		 229 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  58.74 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  55.45 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  55.36 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  55.8 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  55.11 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  55.11 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  55.07 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  55.36 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  55.36 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  54.34 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  56.7 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  56.22 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  52.7 
 
 		 225 aa  255  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  50.92 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  47.75 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  47.75 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.65 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.32 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  47.75 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.3 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.18 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.82 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.2 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.24 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.69 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.29 
 
 		 653 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.36 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  48.87 
 
 		 220 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.05 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  44.92 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.56 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.48 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.09 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  44.25 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  46.93 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.12 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.33 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  47.75 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.48 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  44.98 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.98 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.25 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  42.34 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.34 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.6 
 
 		 644 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.19 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.09 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.05 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.34 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  45.45 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  42.98 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>