23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1755 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.69 
 
 
1362 aa  848    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0350  hypothetical protein  38.76 
 
 
1022 aa  732    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1718  hypothetical protein  49.59 
 
 
903 aa  659    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896038  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0527  hypothetical protein  45.6 
 
 
981 aa  838    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4845  hypothetical protein  50.73 
 
 
829 aa  672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  hitchhiker  0.00200292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4344  hypothetical protein  47.19 
 
 
966 aa  934    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0662196  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1833  hypothetical protein  44.42 
 
 
953 aa  786    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61283  predicted protein  41.12 
 
 
997 aa  758    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0585405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1755  hypothetical protein  100 
 
 
975 aa  2024    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000113788  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3877  hypothetical protein  45.44 
 
 
841 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.454403  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02750  hypothetical protein  44.3 
 
 
885 aa  617  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1622  hypothetical protein  31.33 
 
 
970 aa  489  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3905  hypothetical protein  32.57 
 
 
965 aa  488  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164927  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06210  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 
1083 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0766875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1369  hypothetical protein  39.04 
 
 
868 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2299  hypothetical protein  31.73 
 
 
982 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09329  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
866 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1577  hypothetical protein  47.92 
 
 
307 aa  308  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1578  hypothetical protein  35.81 
 
 
250 aa  161  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1310  hypothetical protein  22.47 
 
 
735 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1316  hypothetical protein  23.03 
 
 
712 aa  95.5  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1618  hypothetical protein  24.42 
 
 
714 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1576  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  44.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.863042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>