More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1739 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  57.14 
 
 
191 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  56.57 
 
 
191 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  57.14 
 
 
191 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  53.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  53.23 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  53.23 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  51.41 
 
 
198 aa  197  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  51.27 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  51.27 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  51.27 
 
 
191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  51.27 
 
 
192 aa  195  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  52.54 
 
 
199 aa  194  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  51.27 
 
 
191 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  51.27 
 
 
192 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  51.27 
 
 
192 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  51.27 
 
 
192 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  51.02 
 
 
192 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  50.76 
 
 
191 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  50.25 
 
 
192 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  191  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  49.24 
 
 
192 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  49 
 
 
191 aa  190  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  49 
 
 
191 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  48.76 
 
 
191 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  50.84 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  48 
 
 
191 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  53.71 
 
 
192 aa  184  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  53.45 
 
 
177 aa  184  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  48.4 
 
 
193 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  53.01 
 
 
192 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  51.06 
 
 
191 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  52.66 
 
 
191 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  51.48 
 
 
188 aa  177  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  53.8 
 
 
176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  49.74 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  45.13 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  49.11 
 
 
189 aa  171  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  53.85 
 
 
191 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  50.89 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  41.87 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  44.44 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  47.12 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  47.16 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  46.59 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  46.59 
 
 
204 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  46.59 
 
 
192 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  46.02 
 
 
192 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  45.45 
 
 
192 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  43.9 
 
 
208 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  44.21 
 
 
179 aa  140  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  39.52 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  43.14 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.92 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  39.68 
 
 
182 aa  121  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  35.71 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  35.71 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  35.32 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  34.38 
 
 
213 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  34.38 
 
 
213 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  36.76 
 
 
196 aa  115  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.58 
 
 
199 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  35.12 
 
 
189 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  38.37 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  35.67 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  34.46 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  33.69 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  35.84 
 
 
183 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.76 
 
 
183 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.36 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.29 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  33.9 
 
 
183 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.06 
 
 
182 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  34.34 
 
 
182 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  35.23 
 
 
225 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  39.6 
 
 
177 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  35.98 
 
 
184 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.53 
 
 
177 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  34.34 
 
 
182 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  37.71 
 
 
196 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.02 
 
 
187 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.09 
 
 
201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  37.33 
 
 
185 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  31.38 
 
 
186 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  31.07 
 
 
182 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  34.27 
 
 
201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  35.43 
 
 
186 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  29.78 
 
 
285 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  33.54 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>