More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1696 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 99 aa  193  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  46.24 
 
 		 228 aa  80.1  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  46.15 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  46.67 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.36 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  53.66 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  50.62 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40.66 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  48.81 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.13 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  48.75 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  43.01 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  47.56 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  41.86 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  41.86 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  40.43 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  43.75 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.48 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  46.84 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.71 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.71 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.08 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  35.87 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.64 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  46.74 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  38.96 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.47 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  44.19 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  42.35 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  42.35 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  41.03 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  38.71 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  36.67 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  35.11 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.36 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.17 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  35.79 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  32.18 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.2 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  32.61 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.78 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.7 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.8 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.44 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  33.75 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  40.7 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>