More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1680 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 874 aa  1794    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  36.68 
 
 		 969 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  36.34 
 
 		 969 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  36.58 
 
 		 968 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  36.58 
 
 		 968 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  36.58 
 
 		 968 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  36.58 
 
 		 968 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  36.64 
 
 		 969 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  35.43 
 
 		 968 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  35.74 
 
 		 967 aa  552  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  35.33 
 
 		 968 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  35.33 
 
 		 968 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  34.81 
 
 		 968 aa  548  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  36.48 
 
 		 967 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  35.96 
 
 		 968 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 		 968 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  36.34 
 
 		 967 aa  548  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  35.66 
 
 		 968 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  35.22 
 
 		 968 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  35.55 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  35.55 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  35.69 
 
 		 968 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  35.57 
 
 		 967 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  35.19 
 
 		 968 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  35.29 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  35.55 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  35.67 
 
 		 968 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  35.73 
 
 		 969 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  35.55 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  35.55 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  35.45 
 
 		 968 aa  545  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  35.05 
 
 		 968 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  35.69 
 
 		 968 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  35.69 
 
 		 968 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  35.66 
 
 		 968 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  35.19 
 
 		 968 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  35.19 
 
 		 968 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  35.19 
 
 		 968 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  36.68 
 
 		 953 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  36.62 
 
 		 948 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  36.52 
 
 		 948 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  37.24 
 
 		 966 aa  538  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  37.28 
 
 		 950 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  35.02 
 
 		 968 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  36.2 
 
 		 948 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  36.69 
 
 		 948 aa  532  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  35.71 
 
 		 948 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  35.95 
 
 		 944 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  37.2 
 
 		 1028 aa  529  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  35.61 
 
 		 948 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  37.1 
 
 		 982 aa  528  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  34.02 
 
 		 968 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  35.89 
 
 		 948 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  36.62 
 
 		 948 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  35.38 
 
 		 975 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  36.6 
 
 		 949 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  34.09 
 
 		 968 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  35.93 
 
 		 947 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  34.31 
 
 		 947 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  34.64 
 
 		 967 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  35.77 
 
 		 958 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  36.09 
 
 		 958 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  35.06 
 
 		 943 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  34.16 
 
 		 970 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  34.66 
 
 		 919 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  35.66 
 
 		 980 aa  489  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  35.9 
 
 		 960 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  34.81 
 
 		 949 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  32.66 
 
 		 982 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  32.7 
 
 		 942 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  29.94 
 
 		 905 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  30.58 
 
 		 898 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  28.65 
 
 		 892 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.58 
 
 		 898 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.81 
 
 		 555 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.91 
 
 		 945 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  25.97 
 
 		 572 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  25.24 
 
 		 467 aa  94.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.58 
 
 		 988 aa  92.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  24.38 
 
 		 952 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 941 aa  91.3  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 941 aa  91.3  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  32.8 
 
 		 960 aa  90.9  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 		 932 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  34.2 
 
 		 929 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.49 
 
 		 1049 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  24.78 
 
 		 952 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  24.55 
 
 		 952 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  24.55 
 
 		 952 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4392  helicase domain protein  30.33 
 
 		 1069 aa  88.6  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  34.05 
 
 		 1172 aa  88.2  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1031 aa  87  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  31.4 
 
 		 962 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  32.34 
 
 		 560 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 1058 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34.13 
 
 		 933 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.92 
 
 		 1045 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 1046 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  32.12 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  32.12 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>