More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1607 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  100 
 
 		 444 aa  887    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  53.27 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  52.14 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  52.51 
 
 		 436 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  51.83 
 
 		 443 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  51.83 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  51.61 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  51.94 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  51.92 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  51.03 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  51.49 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  50.8 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  51.69 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  50.9 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  49.66 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  48.04 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  49.43 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  48.42 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  49.32 
 
 		 434 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  47.29 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  47.06 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  47.06 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  47.06 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  47.92 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  47.06 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  47.38 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  47.39 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  47.29 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  47.34 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  47.34 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  47.85 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  47.34 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  47.81 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  47.61 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  46.61 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  47.18 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  46.83 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  47.61 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  47.61 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  46.17 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  48.06 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  46.61 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  46.61 
 
 		 434 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  46.61 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  47.61 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  46.38 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  47.61 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  47.36 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  47.06 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  47.15 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  47.38 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  45.93 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  46.15 
 
 		 434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  47.11 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  45.5 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  45.03 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  43.51 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  46.28 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  43.68 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  44.11 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  44.04 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  44.85 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  43.28 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  42.24 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  42.47 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  43.89 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  41.8 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  41.8 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  41.74 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  42.03 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  42.07 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  41.61 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  38.43 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  38.62 
 
 		 436 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  40 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  37.69 
 
 		 448 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  39.08 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  39.08 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  39.51 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  39.54 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  41.71 
 
 		 432 aa  326  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  39.07 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  40 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  39.07 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  39.82 
 
 		 447 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  39.07 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  39.08 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  39.49 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  39.07 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  39.69 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  38.85 
 
 		 448 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  39.59 
 
 		 447 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>