259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1579 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 64 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 64 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  79.03 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  79.03 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  76.19 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  75.81 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  75.81 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  75.81 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  74.6 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  63.33 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  64.41 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  65 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  66.1 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2595  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519025  hitchhiker  0.00116473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  63.93 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  63.93 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2907  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.471347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.14 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 65 aa  57  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0470  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.835953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  60.34 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  59.26 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  61.11 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>