More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1551 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  80.25 
 
 		 238 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  75.53 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  74.26 
 
 		 240 aa  377  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  72.69 
 
 		 239 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  69.92 
 
 		 240 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  68.91 
 
 		 237 aa  351  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  68.78 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  68.78 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  68.78 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  67.93 
 
 		 240 aa  349  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  68.35 
 
 		 240 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  67.93 
 
 		 240 aa  345  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  67.51 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  68.49 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  66.67 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  66.24 
 
 		 240 aa  337  7e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  66.53 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  67.09 
 
 		 241 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  65.82 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  66.95 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  66.95 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  65.27 
 
 		 242 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  65.13 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  67.93 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  65.55 
 
 		 241 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  66.1 
 
 		 241 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  65.82 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  66.67 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  66.81 
 
 		 227 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  48.73 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  49.15 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  47.48 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  45.11 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  45.96 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  43.83 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  43.88 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  45.15 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  45.15 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  43.51 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  42.02 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  42.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  41.7 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  41 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  37.97 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  35.59 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  35.47 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  38.99 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  36.16 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  34.62 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  33.76 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  39.27 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  38.64 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  37.82 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  37.82 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  34.62 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.27 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  35.86 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  36.77 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  34.91 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  34.03 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>