42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1532 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  34.1 
 
 
262 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  37.25 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  34.38 
 
 
264 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  33.59 
 
 
275 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  31.78 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  31.56 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  29.71 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  31.18 
 
 
261 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  31.33 
 
 
284 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  31.82 
 
 
265 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  30.17 
 
 
285 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  30.45 
 
 
283 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  27.27 
 
 
269 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  27.71 
 
 
278 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  30.92 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  30.53 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  30.92 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  30.53 
 
 
274 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  30.38 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  29 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  28.99 
 
 
275 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  30.19 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  26.05 
 
 
290 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  29.8 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  29.8 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  29.8 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  27.7 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  26.64 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  29.38 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  30.89 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  30.89 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  25.68 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  26.52 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  25.68 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  30.65 
 
 
321 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  29.32 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  29.32 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  29.32 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  29.32 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  25.59 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>