More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1520 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  37.82 
 
 
264 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  41.38 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  37.39 
 
 
242 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  37.72 
 
 
267 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.87 
 
 
242 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.76 
 
 
239 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  36.96 
 
 
242 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.05 
 
 
242 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  37.07 
 
 
259 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  35.62 
 
 
242 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
276 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
270 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  35.29 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.32 
 
 
243 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  32.76 
 
 
242 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.68 
 
 
258 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
256 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  37.23 
 
 
256 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  35.62 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.84 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  36.16 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.75 
 
 
236 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.92 
 
 
247 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.32 
 
 
251 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.05 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  34.32 
 
 
452 aa  124  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.76 
 
 
237 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  33.76 
 
 
264 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 
320 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
270 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.34 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  33.77 
 
 
421 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  31.2 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 
395 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  35.15 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  34.33 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.8 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  32.76 
 
 
425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00248  phosphoprotein phosphatase  35.55 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  31.65 
 
 
466 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  29.83 
 
 
394 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  34.55 
 
 
274 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.11 
 
 
482 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
417 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
467 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  31.62 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.67 
 
 
478 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.04 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.49 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  30.9 
 
 
293 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.93 
 
 
261 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 
567 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  29.24 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  31.56 
 
 
386 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
296 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.99 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
389 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1112  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  29.87 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.91 
 
 
469 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  32.9 
 
 
247 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  33.77 
 
 
463 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  29.22 
 
 
254 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 
540 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  33.19 
 
 
269 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
245 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  30.42 
 
 
507 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  29.08 
 
 
276 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  32.14 
 
 
478 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.48 
 
 
252 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.93 
 
 
241 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  31.72 
 
 
416 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.17 
 
 
243 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  30.93 
 
 
472 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  33.91 
 
 
558 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  30.25 
 
 
319 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3487  protein serine/threonine phosphatase  27.85 
 
 
240 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.928311  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  30.38 
 
 
266 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  30.04 
 
 
554 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
273 aa  105  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  32.05 
 
 
293 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1505  protein serine/threonine phosphatases  25.7 
 
 
262 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  31.74 
 
 
239 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 
426 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 
240 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  32.51 
 
 
241 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  30.42 
 
 
441 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  31.74 
 
 
239 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  30.64 
 
 
250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>