52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1429 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  317  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  56.58 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  52.29 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  46.05 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  44.08 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  46.05 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  43.4 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  43.51 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  46.09 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  44.53 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  34.69 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  34.69 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  39.84 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  38.28 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  34.46 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  37.16 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.8 
 
 		 193 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  33.6 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  30.91 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.4 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.6 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.91 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.91 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.4 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.6 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.6 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.25 
 
 		 194 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  37.21 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.4 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.65 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  34.52 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  37.97 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  42.25 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  39.44 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  28 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0533  NADPH-dependent FMN reductase  37.04 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  30.68 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  36.78 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  35.63 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>