87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1318 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  61.29 
 
 		 822 aa  1058    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  62.82 
 
 		 831 aa  1116    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  66.05 
 
 		 813 aa  1176    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  50.74 
 
 		 815 aa  895    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  66.05 
 
 		 813 aa  1176    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  64.98 
 
 		 811 aa  1135    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  70.53 
 
 		 811 aa  1230    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  41.03 
 
 		 784 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  68.43 
 
 		 811 aa  1186    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  61.96 
 
 		 822 aa  1071    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  64.03 
 
 		 819 aa  1093    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  58.82 
 
 		 827 aa  1002    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  100 
 
 		 811 aa  1691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  41.56 
 
 		 790 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  65.6 
 
 		 811 aa  1158    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  52.88 
 
 		 815 aa  897    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  38.71 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  40.34 
 
 		 784 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  36.18 
 
 		 823 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  35.27 
 
 		 801 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  35.38 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  34.91 
 
 		 802 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  33.53 
 
 		 794 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  34.29 
 
 		 797 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  33.21 
 
 		 797 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  33.41 
 
 		 829 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  32.71 
 
 		 824 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  31.91 
 
 		 809 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  33.21 
 
 		 762 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  30.96 
 
 		 797 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  31.05 
 
 		 796 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  32.72 
 
 		 786 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  32.2 
 
 		 849 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.86 
 
 		 2901 aa  327  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  28.62 
 
 		 2845 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  28.94 
 
 		 2922 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  28.38 
 
 		 3021 aa  312  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  27.34 
 
 		 1303 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  28.14 
 
 		 2887 aa  308  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  28.45 
 
 		 2932 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  28.82 
 
 		 2864 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  26.76 
 
 		 2888 aa  296  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  27.63 
 
 		 2748 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  27.3 
 
 		 2929 aa  295  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  27.78 
 
 		 2823 aa  294  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  28.26 
 
 		 2916 aa  294  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  28.88 
 
 		 2842 aa  293  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  29.09 
 
 		 2905 aa  291  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  28.14 
 
 		 2868 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.04 
 
 		 2732 aa  289  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 		 2831 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  29.16 
 
 		 2864 aa  289  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  27.62 
 
 		 2859 aa  286  8e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  26.92 
 
 		 2864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  26.99 
 
 		 2747 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  28.03 
 
 		 2881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  27.07 
 
 		 2868 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  28.05 
 
 		 2860 aa  283  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  26.32 
 
 		 2786 aa  282  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 		 2875 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  27.44 
 
 		 2874 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  27.68 
 
 		 2761 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  26.75 
 
 		 2839 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  26.85 
 
 		 2839 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  27.07 
 
 		 2880 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  27.41 
 
 		 2716 aa  271  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  27.48 
 
 		 2748 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  27.27 
 
 		 2758 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  25.61 
 
 		 2833 aa  266  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  25.7 
 
 		 2870 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  26.52 
 
 		 2769 aa  259  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  29.36 
 
 		 624 aa  257  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  26.74 
 
 		 2884 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  25.88 
 
 		 2793 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  25.69 
 
 		 2730 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  25.06 
 
 		 2779 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  24.84 
 
 		 2731 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  22.86 
 
 		 788 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.83 
 
 		 802 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  21.18 
 
 		 801 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  25 
 
 		 984 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  34.57 
 
 		 2453 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.41 
 
 		 900 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  22.38 
 
 		 904 aa  67.4  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  25 
 
 		 1100 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1094 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05740  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 		 793 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00996322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>