More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1298 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1298  thioredoxin  100 
 
 		 118 aa  240  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.393831  decreased coverage  0.00542424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  57.01 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  54.72 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1430  HIT family hydrolase  55.66 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01311  HIT (histidine triad) family protein  55.66 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  53.21 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  51.85 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  53.77 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  56.31 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  56.31 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1971  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  54.29 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0413  HIT (histidine triad) family protein  51.89 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  49.07 
 
 		 367 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00761  HIT (histidine triad) family protein  51.89 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0278345  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 116 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  50 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03141  HIT (histidine triad) family protein  50.94 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  49.51 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  49.09 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  48.15 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  52.38 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  50.94 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  47.57 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  49.52 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  52.43 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  47.57 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  51.96 
 
 		 115 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00781  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00791  HIT (histidine triad) family protein  46.79 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715274  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0069  HIT (histidine triad) family protein  45.87 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  47.62 
 
 		 116 aa  103  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  48.51 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  50.98 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  45.79 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  45.79 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  45.79 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  45.95 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  45.1 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.6 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  45.28 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  46.6 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  50.47 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  43.81 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  41.28 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  49.5 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  43.12 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0114  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 		 118 aa  98.2  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.588247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16130  predicted protein  43.64 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.145557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01519  hypothetical protein  40.19 
 
 		 116 aa  97.1  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1120  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.66019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1214  histidine triad-like protein  47.66 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004003  HIT family hydrolase  41.28 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  46.08 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  43.52 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  41.28 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>