More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1254 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  65.08 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  60.55 
 
 		 550 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2943  phosphoglucomutase  59.07 
 
 		 550 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  65.27 
 
 		 546 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  61.07 
 
 		 545 aa  688    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  64.17 
 
 		 547 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  64.3 
 
 		 548 aa  729    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  63 
 
 		 553 aa  683    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  60.73 
 
 		 550 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  60 
 
 		 550 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  59.15 
 
 		 548 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  60.29 
 
 		 547 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  59.81 
 
 		 545 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  60.63 
 
 		 546 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  65.27 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  59.33 
 
 		 548 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  63.17 
 
 		 545 aa  694    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  60.56 
 
 		 550 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  61.92 
 
 		 550 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.3 
 
 		 547 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  60.62 
 
 		 550 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  60.63 
 
 		 548 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  60.36 
 
 		 550 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  60.29 
 
 		 546 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  66.79 
 
 		 550 aa  730    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  63.39 
 
 		 548 aa  720    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  65.08 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  62.91 
 
 		 550 aa  714    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  60 
 
 		 547 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  61.93 
 
 		 551 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  64.65 
 
 		 547 aa  738    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  60.29 
 
 		 546 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  65.27 
 
 		 546 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  65.33 
 
 		 547 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  59.86 
 
 		 559 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  64.96 
 
 		 547 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  59.92 
 
 		 546 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  60.73 
 
 		 557 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  64.66 
 
 		 549 aa  730    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  60.11 
 
 		 546 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  63.84 
 
 		 545 aa  709    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  62.66 
 
 		 550 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  62.82 
 
 		 547 aa  701    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  58.11 
 
 		 559 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  100 
 
 		 546 aa  1121    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  61.22 
 
 		 550 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  63 
 
 		 547 aa  698    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0545  phosphoglucomutase  57.22 
 
 		 561 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  58.73 
 
 		 568 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  62.48 
 
 		 550 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  60.99 
 
 		 546 aa  679    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  65.27 
 
 		 546 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  65.88 
 
 		 547 aa  726    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  62.59 
 
 		 547 aa  712    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  58.26 
 
 		 553 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  66.24 
 
 		 549 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  61.07 
 
 		 545 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  60.22 
 
 		 551 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  64.96 
 
 		 547 aa  723    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  59.78 
 
 		 551 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  65.27 
 
 		 546 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  60.95 
 
 		 549 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  59.45 
 
 		 550 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  60 
 
 		 550 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  61.17 
 
 		 547 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  64.9 
 
 		 546 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  64.61 
 
 		 552 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  718    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  61.37 
 
 		 549 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  59.82 
 
 		 550 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  64.96 
 
 		 547 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  59.64 
 
 		 550 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  64.02 
 
 		 553 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  62.25 
 
 		 553 aa  681    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  65.08 
 
 		 546 aa  717    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  64.53 
 
 		 546 aa  721    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  61.21 
 
 		 564 aa  643    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1706  phosphoglucomutase  60.91 
 
 		 560 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  58.26 
 
 		 553 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  70.73 
 
 		 550 aa  805    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  60.92 
 
 		 547 aa  683    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  58.48 
 
 		 563 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  60.15 
 
 		 551 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  59.25 
 
 		 553 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  55.9 
 
 		 547 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2332  phosphoglucomutase  61.78 
 
 		 551 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90326  hitchhiker  0.000453174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  63.99 
 
 		 547 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  60.18 
 
 		 550 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  64.78 
 
 		 547 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  60 
 
 		 545 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  59.31 
 
 		 548 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  60.55 
 
 		 550 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  64.66 
 
 		 548 aa  730    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  60.18 
 
 		 561 aa  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  60.55 
 
 		 550 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  58.26 
 
 		 553 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>