24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1215 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  100 
 
 		 993 aa  1984    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  28.54 
 
 		 939 aa  258  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  27.94 
 
 		 866 aa  121  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  28.09 
 
 		 827 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  28.09 
 
 		 827 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  25.06 
 
 		 827 aa  109  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  27.92 
 
 		 827 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  27.92 
 
 		 827 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  27.23 
 
 		 826 aa  98.2  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  27.41 
 
 		 828 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  27.78 
 
 		 828 aa  95.9  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  27.68 
 
 		 828 aa  93.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  25.94 
 
 		 824 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  27.07 
 
 		 827 aa  92.8  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  27.07 
 
 		 828 aa  92.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  26.91 
 
 		 872 aa  92  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  27.66 
 
 		 823 aa  89.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  25.77 
 
 		 856 aa  82.8  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  27.52 
 
 		 832 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  27.1 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  26.51 
 
 		 839 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  26.1 
 
 		 826 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  25.46 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  26.72 
 
 		 829 aa  64.7  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>