177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1097 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  100 
 
 		 385 aa  794    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  52.37 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  50.79 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  50.79 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  50.9 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  50.53 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  48.95 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  48.79 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  49.61 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  48.44 
 
 		 388 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  48.8 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  51.07 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  48.31 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  48.81 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  48.16 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  48.16 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  48.16 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  46.88 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  49.87 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  45.26 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  46.38 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  45.26 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  45.26 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  45.26 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  45.26 
 
 		 382 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  49.21 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  45 
 
 		 382 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  44.74 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  49.73 
 
 		 385 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  47.66 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  47.14 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  44.85 
 
 		 393 aa  329  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  43.12 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  43.38 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  43.23 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  45.11 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  42.6 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  42.97 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  42.34 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  43.47 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.68 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  42.09 
 
 		 391 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  37.73 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.53 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  40.21 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  38.96 
 
 		 382 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.62 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.37 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  41.45 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  39.83 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  40 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  39.58 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  39.74 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  39.42 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.53 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  42.19 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  38.9 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  40.43 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  40.48 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  39.66 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  37.14 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  35.79 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  35.57 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.31 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  37.23 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  38.42 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  37.56 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.33 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  37.04 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.27 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.46 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  38.24 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.36 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.23 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  35.34 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.23 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  38.29 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  34.46 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.01 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  37.08 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  35.47 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  39.45 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  34.02 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  37.61 
 
 		 355 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  35.43 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.44 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  36.57 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.53 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  38.29 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.78 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.36 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>