More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1087 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  100 
 
 		 460 aa  949    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  42.04 
 
 		 470 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  45.33 
 
 		 441 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  41.63 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  41.56 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  42.26 
 
 		 459 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  41.39 
 
 		 433 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  51.29 
 
 		 498 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  40.55 
 
 		 468 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  40.34 
 
 		 466 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  40.34 
 
 		 466 aa  348  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  40.65 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  40.21 
 
 		 468 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  41.68 
 
 		 475 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  40.13 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  40.43 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  44.85 
 
 		 439 aa  344  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  43.05 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  39.96 
 
 		 468 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  48.88 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  49.44 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  46.07 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  43.49 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  46.42 
 
 		 353 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  45.83 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  44.35 
 
 		 475 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  40.93 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.09 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.61 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  45.77 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.77 
 
 		 474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.03 
 
 		 473 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  44.04 
 
 		 475 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.37 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  44.04 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  43.41 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  44.92 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.86 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.32 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  38.59 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.52 
 
 		 741 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.75 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.02 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.92 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.64 
 
 		 438 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  38.64 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.57 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.15 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.3 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  31.3 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  34.17 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.51 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.16 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.83 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  39.53 
 
 		 439 aa  217  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  34.65 
 
 		 477 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.64 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  37.6 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.81 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  33.43 
 
 		 472 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  30.97 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  33.92 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  33.92 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  33.92 
 
 		 431 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  39.93 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  33.9 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  34.06 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.54 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  37.65 
 
 		 404 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.24 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  35.44 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  35.39 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.99 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  32.84 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.92 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.58 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  32.84 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  32.84 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  32.84 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  35.04 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.26 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.52 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  33.33 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.74 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  34.84 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  34.12 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.69 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  31.77 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  35.47 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  33.5 
 
 		 454 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  31.71 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  33.51 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  30.23 
 
 		 438 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  30.23 
 
 		 438 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  34.68 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  29.58 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  33.78 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.13 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>