33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1065 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  100 
 
 		 299 aa  618  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  35.54 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92920  predicted protein  32.08 
 
 		 507 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728823  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  30.64 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  30 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  32.39 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  30.3 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  29.27 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  29.17 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  32.28 
 
 		 758 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  26.29 
 
 		 891 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  26.29 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  34.29 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  30.23 
 
 		 726 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  32.82 
 
 		 727 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  27.88 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  27.22 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  32 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  28.92 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  33.98 
 
 		 641 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  29.25 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  24 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  29.22 
 
 		 596 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  30.36 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44231  predicted protein  27.4 
 
 		 814 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  27.07 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  27.07 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  26.32 
 
 		 694 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  27.4 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  31.36 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28912  predicted protein  24.05 
 
 		 699 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.597886  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  24.73 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>