26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1025 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  100 
 
 		 754 aa  1566    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  50.42 
 
 		 707 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  57.29 
 
 		 726 aa  840    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  50.5 
 
 		 710 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  54.19 
 
 		 731 aa  767    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  51.4 
 
 		 730 aa  742    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  56.4 
 
 		 709 aa  798    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  52.07 
 
 		 717 aa  797    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  41.87 
 
 		 697 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  44.12 
 
 		 683 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  43.07 
 
 		 1154 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  42.71 
 
 		 693 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  44.87 
 
 		 685 aa  522  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  45.88 
 
 		 674 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  41.07 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  45.71 
 
 		 674 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  46.88 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  40.99 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  37.66 
 
 		 826 aa  446  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  41.61 
 
 		 677 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  40.34 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  36.74 
 
 		 847 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  41.32 
 
 		 679 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  39.97 
 
 		 683 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  39.26 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  37.79 
 
 		 705 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>