More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1011 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 373 aa  753    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  65.23 
 
 		 372 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  65.23 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  66.03 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  64.52 
 
 		 378 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  64.96 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  63 
 
 		 375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  64.42 
 
 		 372 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  63.61 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  63.88 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  61.99 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  64.42 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  64.15 
 
 		 373 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  57.64 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  63.61 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  63.34 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  58.18 
 
 		 374 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  58.56 
 
 		 376 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  60.16 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 		 374 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  63.9 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  59.63 
 
 		 374 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  59.73 
 
 		 372 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  57.41 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  58.76 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  59.03 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  57.45 
 
 		 371 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  58.76 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  57.99 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  57.91 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  58.22 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  58.06 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  57.75 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  57.95 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  57.75 
 
 		 374 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  57.68 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  56.33 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  57.68 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  57.68 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  57.41 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  54.35 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  56.91 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  57.41 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  57.41 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  57.22 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  55.53 
 
 		 372 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  56.68 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  56.68 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  54.35 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  58.65 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  54.08 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  54.35 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  54.74 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  52.39 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  54.74 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0844  gamma-glutamyl kinase  53.35 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.481777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0773  gamma-glutamyl kinase  53.35 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  52.42 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3672  gamma-glutamyl kinase  55.11 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.039065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  48.21 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.63 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.97 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1783  glutamate 5-kinase  50.92 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00674296  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1460  glutamate 5-kinase  50.66 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  46.92 
 
 		 392 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1682  gamma-glutamyl kinase  48.42 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1503  gamma-glutamyl kinase  48.16 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1600  gamma-glutamyl kinase  48.09 
 
 		 405 aa  317  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157762  hitchhiker  0.000100305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  46.38 
 
 		 373 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.51 
 
 		 376 aa  311  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  45.09 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  43.85 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  45.23 
 
 		 373 aa  309  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  46.3 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.31 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.31 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.69 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  46.59 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  45.15 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  44.09 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  42.9 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  44.41 
 
 		 367 aa  298  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>