More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0935 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  100 
 
 
429 aa  888    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  56.73 
 
 
419 aa  494  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  56.7 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  56.19 
 
 
418 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  56.35 
 
 
420 aa  484  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  54.92 
 
 
420 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  55.66 
 
 
421 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  55.72 
 
 
420 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  53.12 
 
 
419 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  52.9 
 
 
420 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  52.66 
 
 
420 aa  461  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  52.3 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  52.06 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  53.72 
 
 
419 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  49.28 
 
 
421 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  50.12 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  50 
 
 
427 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  50 
 
 
417 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  48.43 
 
 
418 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  48.91 
 
 
418 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  45.43 
 
 
407 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  46.77 
 
 
394 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  48.32 
 
 
422 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  46.73 
 
 
418 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  45.64 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  43.41 
 
 
418 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  41.75 
 
 
424 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  42.75 
 
 
415 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  41.36 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  43.27 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  38.07 
 
 
414 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  39.04 
 
 
415 aa  289  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  41.35 
 
 
409 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  38.52 
 
 
400 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  38.52 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  37.72 
 
 
414 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  37.04 
 
 
408 aa  250  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  35.09 
 
 
404 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  34.59 
 
 
403 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  32.18 
 
 
447 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  33.72 
 
 
460 aa  223  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  35.51 
 
 
404 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  33.99 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  34.4 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  36.65 
 
 
404 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 
404 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  34.54 
 
 
406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  30.56 
 
 
406 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  33.25 
 
 
404 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 
405 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30 
 
 
378 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  30.36 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  33.91 
 
 
370 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
388 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.28 
 
 
346 aa  126  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  33.21 
 
 
348 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  32.81 
 
 
368 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  29.01 
 
 
340 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  31.07 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.17 
 
 
341 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.62 
 
 
360 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  34.91 
 
 
367 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  29.46 
 
 
346 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  32.46 
 
 
373 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  29.71 
 
 
341 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.4 
 
 
341 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.1 
 
 
340 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  28.27 
 
 
341 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  33.72 
 
 
360 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  30.48 
 
 
372 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  34.07 
 
 
342 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.11 
 
 
342 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  30.25 
 
 
356 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  29.12 
 
 
341 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  31.85 
 
 
359 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.42 
 
 
341 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.11 
 
 
342 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  32.4 
 
 
372 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.08 
 
 
341 aa  99.8  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  34.76 
 
 
364 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  29.29 
 
 
344 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  30.84 
 
 
345 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  29.49 
 
 
363 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  27.47 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  31.72 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  31.01 
 
 
364 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  31.47 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  28.68 
 
 
341 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  32.74 
 
 
365 aa  96.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  34.65 
 
 
362 aa  96.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  32.68 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  33.65 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.01 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  32.09 
 
 
363 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  30.97 
 
 
341 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  31.87 
 
 
359 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  30.77 
 
 
368 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  31.33 
 
 
370 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  28.9 
 
 
343 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>