More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0908 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  100 
 
 		 175 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0538  lytic transglycosylase, catalytic  56.52 
 
 		 194 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.527113  hitchhiker  0.00520856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  49.71 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  49.09 
 
 		 221 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0643  lytic transglycosylase, catalytic  44.81 
 
 		 203 aa  151  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.849619  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  49.28 
 
 		 190 aa  140  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3099  lytic transglycosylase, catalytic  48.87 
 
 		 251 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2951  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 		 241 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2113  hypothetical protein  39.76 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3060  Lytic transglycosylase catalytic  41.42 
 
 		 253 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2650  Lytic transglycosylase catalytic  41.42 
 
 		 253 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.562869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  47.37 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5480  lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2391  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0776  Lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0847  lytic transglycosylase, catalytic  47.41 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3669  lytic transglycosylase, catalytic  46.67 
 
 		 226 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4211  Lytic transglycosylase catalytic  41.04 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 223 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0744  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 		 221 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0220327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  39.41 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0832  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0518  putative signal peptide protein  38.46 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0028  putative soluble lytic murein transglycosylase- related protein  39.52 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0262  hypothetical protein  36.63 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 603 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.05 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4539  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5063  lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  32.62 
 
 		 442 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.89 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.52 
 
 		 715 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3533  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.89 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  36.19 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  31.91 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  37.89 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  35.24 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 251 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 251 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2007  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00437999  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 251 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40.59 
 
 		 251 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  32.41 
 
 		 260 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  34.56 
 
 		 242 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  37.89 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.3 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40.66 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.61 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  37.89 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 661 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  33.67 
 
 		 661 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  39.33 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  39.77 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  33.68 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  32.81 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 660 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  29.85 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0187  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0753643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 362 aa  57.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  33.68 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.64 
 
 		 709 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.36 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  34.55 
 
 		 709 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  33.68 
 
 		 261 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0915  lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 		 378 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.423978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  33.68 
 
 		 261 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2444  lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0474  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 378 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0812  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0953  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 378 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>