More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0897 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  100 
 
 		 610 aa  1243    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.27 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.29 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.1 
 
 		 614 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.27 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  42.86 
 
 		 612 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.27 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.27 
 
 		 615 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.32 
 
 		 615 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.91 
 
 		 615 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.14 
 
 		 613 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.36 
 
 		 613 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.32 
 
 		 613 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.92 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.03 
 
 		 620 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  39.03 
 
 		 616 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.32 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  40.03 
 
 		 616 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.72 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  40.17 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.96 
 
 		 617 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.9 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.16 
 
 		 613 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  38.17 
 
 		 617 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.43 
 
 		 613 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.94 
 
 		 629 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.14 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.03 
 
 		 640 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  35.95 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.88 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  36.11 
 
 		 616 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  38.88 
 
 		 633 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  36.05 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.05 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  36.05 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  35.89 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  36.05 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  36.05 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  36.05 
 
 		 618 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  35.89 
 
 		 618 aa  364  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.88 
 
 		 616 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  36.05 
 
 		 618 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  36.56 
 
 		 618 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  37.41 
 
 		 621 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  34.73 
 
 		 618 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  34.73 
 
 		 618 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  34.57 
 
 		 618 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  34.73 
 
 		 618 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  34.57 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  36.57 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.7 
 
 		 617 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  37.13 
 
 		 616 aa  340  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  36.75 
 
 		 616 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  37.19 
 
 		 616 aa  333  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.18 
 
 		 626 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  32.9 
 
 		 618 aa  317  4e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.44 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.32 
 
 		 661 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.03 
 
 		 625 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.01 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.01 
 
 		 598 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  32.28 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.89 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.34 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.9 
 
 		 590 aa  270  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.6 
 
 		 605 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  33.9 
 
 		 609 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  34.28 
 
 		 609 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.78 
 
 		 595 aa  261  4e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.57 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  33.7 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  32.15 
 
 		 611 aa  254  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.94 
 
 		 589 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  32.19 
 
 		 513 aa  247  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.9 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.27 
 
 		 563 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.4 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  32.72 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.89 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.34 
 
 		 604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.79 
 
 		 584 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  30.19 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.9 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.9 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.52 
 
 		 595 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.28 
 
 		 649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  28.45 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.62 
 
 		 593 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  33.7 
 
 		 601 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.44 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.06 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.51 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.34 
 
 		 570 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.52 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  44.22 
 
 		 656 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  29.2 
 
 		 601 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.6 
 
 		 834 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.3 
 
 		 561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>