More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0868 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  100 
 
 
318 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  50.47 
 
 
321 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  48.43 
 
 
316 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  42.36 
 
 
528 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 
316 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  40.76 
 
 
531 aa  248  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
351 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 
365 aa  238  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  37.32 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
410 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  43.77 
 
 
298 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  42.14 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.97 
 
 
311 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  43.15 
 
 
257 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  46.7 
 
 
391 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
319 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.72 
 
 
299 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
313 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
355 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
450 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
230 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2020  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.31 
 
 
153 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
230 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
230 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
230 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  28.5 
 
 
291 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
229 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
253 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
287 aa  85.9  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.25 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
242 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.63 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  25.3 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
586 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.78 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  27.45 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  27.65 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  23.1 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  25.11 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  23.95 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.46 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.22 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
262 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
245 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>