31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0834 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  33.77 
 
 
246 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  27.88 
 
 
241 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  28.14 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  24.46 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  27.94 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  27.16 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  23.98 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  23.98 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  27.05 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  25.6 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  24.74 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  28.4 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  25.68 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  25.68 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  26.46 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  25.68 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  27.15 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  26.01 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  24.57 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  24.57 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  26.06 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  24 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  24 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  31.65 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  24.22 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  25.64 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  24.75 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  31.45 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  24.1 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>