More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0832 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  100 
 
 		 585 aa  1180    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.34 
 
 		 591 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  40 
 
 		 585 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.25 
 
 		 575 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  40.52 
 
 		 575 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  33.5 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  34.12 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  35.53 
 
 		 579 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  36.16 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  33.63 
 
 		 538 aa  241  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  33.02 
 
 		 573 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.42 
 
 		 582 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  30.74 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.6 
 
 		 574 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  31.3 
 
 		 575 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.66 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  32.79 
 
 		 574 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  32.79 
 
 		 574 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  32.79 
 
 		 574 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  32.61 
 
 		 574 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  31.83 
 
 		 574 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.79 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.79 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.61 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  32.38 
 
 		 571 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  31.53 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.37 
 
 		 608 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  27.83 
 
 		 629 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  29.31 
 
 		 613 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.21 
 
 		 614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.07 
 
 		 606 aa  163  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  30.24 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.49 
 
 		 569 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.61 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.34 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  25.09 
 
 		 627 aa  158  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.3 
 
 		 470 aa  157  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.76 
 
 		 615 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  30.3 
 
 		 669 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.97 
 
 		 569 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.35 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.07 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.75 
 
 		 636 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  30.21 
 
 		 602 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  31.05 
 
 		 577 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.89 
 
 		 591 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.22 
 
 		 580 aa  144  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  29.75 
 
 		 625 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.05 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.08 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  24.28 
 
 		 631 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.85 
 
 		 577 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  26.34 
 
 		 627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  28.41 
 
 		 562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  24.6 
 
 		 624 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.5 
 
 		 589 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.62 
 
 		 598 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.41 
 
 		 584 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.53 
 
 		 620 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.03 
 
 		 754 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  30.38 
 
 		 464 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 593 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.38 
 
 		 464 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.45 
 
 		 593 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  29.95 
 
 		 597 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.32 
 
 		 589 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.57 
 
 		 589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.74 
 
 		 461 aa  132  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  33.82 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  28.37 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  25.77 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  27.29 
 
 		 593 aa  127  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  30.19 
 
 		 590 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  30.68 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  25.65 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1257  chloride channel-like  32.34 
 
 		 615 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  29.28 
 
 		 605 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.97 
 
 		 598 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.93 
 
 		 560 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  28.27 
 
 		 564 aa  123  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.53 
 
 		 519 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  28.96 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  28.96 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.7 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.92 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  25.94 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  29.18 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.06 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  26.28 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  25.64 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.35 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  30.77 
 
 		 605 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  29.47 
 
 		 863 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.54 
 
 		 603 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1772  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.1 
 
 		 585 aa  116  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  27.05 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>