159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0831 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  289  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  63.04 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  58.39 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  59.85 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  63.41 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  59.12 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  59.85 
 
 		 141 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  59.12 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  63.41 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  60.16 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  56.2 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  56.62 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  58.87 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  55.07 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  58.87 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  60.66 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  57.85 
 
 		 140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  52.17 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  55.65 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  56.2 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  54.84 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  47.83 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  54.4 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  54.47 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  55.28 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  48.8 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  48 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  50.41 
 
 		 172 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  47.48 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  47.48 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  47.48 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  44.6 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  44.2 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  43.88 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  43.88 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  43.97 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  43.26 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  46.77 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  41.73 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  46.34 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  45.32 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  44.2 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  43.88 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  46.43 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  42.75 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  46.34 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  43.88 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  43.48 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  44.8 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  40.15 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  44.88 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  36.81 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  39.72 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  42.52 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  41.73 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  40.71 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  38.03 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  41.01 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  39.13 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  40.28 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  38.3 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  37.96 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  37.68 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  40.28 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  44 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  44 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  41.43 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  44 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  38.36 
 
 		 195 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  38.89 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  38.89 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  39.04 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  36.96 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  35.77 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  38.19 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  38.19 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  38.19 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>