64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0777 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 		 314 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  67.94 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  67.3 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.35 
 
 		 315 aa  434  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.78 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  58.12 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.79 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.79 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.79 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  57.79 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  55.7 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  54.46 
 
 		 341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  54.79 
 
 		 362 aa  341  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  51.62 
 
 		 580 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  52.23 
 
 		 340 aa  338  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.94 
 
 		 648 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.37 
 
 		 505 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.86 
 
 		 378 aa  315  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.86 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  50.81 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  48.68 
 
 		 377 aa  305  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.37 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.54 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  45.9 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.03 
 
 		 426 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.76 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.76 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.11 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.14 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.86 
 
 		 376 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.65 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.19 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  32.44 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.44 
 
 		 507 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  30.91 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  30.91 
 
 		 349 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.87 
 
 		 2073 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.1 
 
 		 466 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 628 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  28.85 
 
 		 627 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.06 
 
 		 607 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.21 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 634 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 517 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 502 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  27.04 
 
 		 710 aa  83.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.87 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  28.33 
 
 		 713 aa  67  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  23.74 
 
 		 1278 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.09 
 
 		 522 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.35 
 
 		 524 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  22.62 
 
 		 472 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.11 
 
 		 338 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.45 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  23.91 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  24.22 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>