More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0755 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  78.04 
 
 		 214 aa  362  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  82.59 
 
 		 217 aa  357  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  76.74 
 
 		 215 aa  348  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  74.3 
 
 		 214 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  73.83 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  73.36 
 
 		 214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  72.9 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  72.9 
 
 		 223 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  72.9 
 
 		 214 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  71.96 
 
 		 214 aa  331  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  71.96 
 
 		 214 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  69 
 
 		 211 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 210 aa  304  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  68 
 
 		 210 aa  304  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  68 
 
 		 210 aa  303  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  68.34 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  68.34 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  68.34 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  68.34 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  68 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  68 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  67.5 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  68.34 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  68 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  65.55 
 
 		 214 aa  300  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  68.5 
 
 		 211 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  68.18 
 
 		 212 aa  294  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  61.27 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  61.31 
 
 		 198 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  58.54 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.79 
 
 		 212 aa  251  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  50.24 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3715  cAMP-regulatory protein  48.15 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.088887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0792  cAMP-regulatory protein  47.55 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0879  cAMP-regulatory protein  49.27 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000144762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2246  cAMP-regulatory protein  48.47 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0793  transcriptional regulator Vfr  82.76 
 
 		 118 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.95 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  37.04 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  36.67 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.83 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.66 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.91 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  35.2 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  98.6  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.64 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.52 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.15 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.87 
 
 		 242 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.33 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.89 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>