More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0694 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  59.21 
 
 		 284 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  60.28 
 
 		 143 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  58.87 
 
 		 145 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  59.57 
 
 		 143 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  56.94 
 
 		 145 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  55.94 
 
 		 144 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  56.83 
 
 		 139 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  56.83 
 
 		 139 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  59.42 
 
 		 140 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  55.63 
 
 		 143 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  55.63 
 
 		 143 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  57.45 
 
 		 141 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  54.93 
 
 		 143 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  57.97 
 
 		 140 aa  165  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  58.16 
 
 		 143 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 145 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 145 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 145 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  54.79 
 
 		 145 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 145 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  57.45 
 
 		 145 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  57.45 
 
 		 143 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  60.31 
 
 		 140 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  56.3 
 
 		 143 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  60.83 
 
 		 141 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  54.01 
 
 		 141 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  49.62 
 
 		 137 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  58.68 
 
 		 122 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  53.33 
 
 		 138 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  51.37 
 
 		 142 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.79 
 
 		 155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  48.25 
 
 		 143 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.06 
 
 		 137 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  52.46 
 
 		 145 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  49.25 
 
 		 139 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  50.36 
 
 		 140 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2105  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.89 
 
 		 144 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  48.92 
 
 		 137 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3319  hypothetical protein  47.45 
 
 		 138 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361879  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  45.14 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  44.76 
 
 		 146 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.65 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.65 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.41 
 
 		 142 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  47.41 
 
 		 142 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  46.51 
 
 		 137 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  44.2 
 
 		 143 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  48.53 
 
 		 147 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4614  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.26 
 
 		 144 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  47.79 
 
 		 147 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  45.97 
 
 		 137 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  47.06 
 
 		 147 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  50.41 
 
 		 144 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5290  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.7 
 
 		 137 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  45.16 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  44.17 
 
 		 137 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61410  hypothetical protein  43.94 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.510351 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  45.16 
 
 		 137 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.8 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  43.31 
 
 		 149 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.8 
 
 		 151 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  45.83 
 
 		 137 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5247  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.55 
 
 		 145 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  43.07 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  43.31 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.34 
 
 		 151 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.91 
 
 		 149 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.34 
 
 		 151 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.34 
 
 		 151 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  44.17 
 
 		 391 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.94 
 
 		 137 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.73 
 
 		 145 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4467  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.25 
 
 		 144 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358832  normal  0.022389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.1 
 
 		 138 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  41.94 
 
 		 140 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  43.51 
 
 		 137 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 		 139 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  46.34 
 
 		 143 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  43.51 
 
 		 137 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  41.43 
 
 		 146 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 		 140 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  40.32 
 
 		 139 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 		 140 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  40.32 
 
 		 139 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  42.5 
 
 		 137 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  40.32 
 
 		 139 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.64 
 
 		 135 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  42.03 
 
 		 139 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5925  hypothetical protein  40.29 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  45 
 
 		 145 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>