33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0677 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0355  polysaccharide deacetylase  48.98 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3729  polysaccharide deacetylase family protein  36.11 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1907  polysaccharide deacetylase  38.67 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6253  polysaccharide deacetylase  34.85 
 
 		 332 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.808766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  25.56 
 
 		 1748 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1097  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  27.57 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1098  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 843 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 		 500 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.58 
 
 		 1124 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 705 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  21.89 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  20.7 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000111858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  22.69 
 
 		 600 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  26 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  36.62 
 
 		 275 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  27.78 
 
 		 234 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 275 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>