More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0663 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  42.65 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  41.91 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  41.91 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  43.88 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  40.44 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  40 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  39.71 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.14 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  43.26 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  39.86 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.44 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40.44 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  43.57 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  36.81 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  36.64 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  35.97 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3781  response regulator receiver domain-containing protein  33.57 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.3 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  34.81 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  34.53 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  37.31 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  35 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  33.57 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>