272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0649 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 867 aa  1737    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.94 
 
 		 927 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  49.23 
 
 		 812 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.81 
 
 		 998 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  48.95 
 
 		 775 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  48.25 
 
 		 875 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  45.19 
 
 		 885 aa  492  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  47.1 
 
 		 1100 aa  489  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  42.16 
 
 		 1224 aa  486  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 895 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  45.85 
 
 		 864 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.44 
 
 		 762 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  46.33 
 
 		 851 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  43.69 
 
 		 874 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  40.44 
 
 		 1105 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.71 
 
 		 786 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.99 
 
 		 611 aa  359  9e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  33.97 
 
 		 578 aa  274  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  32.01 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  30.83 
 
 		 591 aa  257  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.23 
 
 		 582 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  30.92 
 
 		 571 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  33.79 
 
 		 854 aa  243  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 649 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  30.23 
 
 		 646 aa  201  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 1601 aa  185  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  29.39 
 
 		 537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  26.96 
 
 		 833 aa  157  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.92 
 
 		 900 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  63.54 
 
 		 725 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  28.3 
 
 		 665 aa  121  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  26.81 
 
 		 739 aa  120  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  61.29 
 
 		 791 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  55.21 
 
 		 561 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  25.91 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  85.19 
 
 		 619 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  50.51 
 
 		 700 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  48.42 
 
 		 511 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 606 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.61 
 
 		 803 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 742 aa  88.6  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  45.16 
 
 		 933 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.33 
 
 		 887 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  41.24 
 
 		 787 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  51.76 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  64.81 
 
 		 621 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 730 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  38.53 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  73.33 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.55 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.24 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  40.4 
 
 		 914 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  44.21 
 
 		 403 aa  77  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  41.94 
 
 		 422 aa  76.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.75 
 
 		 727 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 1209 aa  76.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.67 
 
 		 763 aa  75.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  24.89 
 
 		 526 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  41.76 
 
 		 393 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  39.8 
 
 		 854 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  27.43 
 
 		 1076 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40.86 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 846 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.37 
 
 		 1137 aa  71.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  25.48 
 
 		 984 aa  71.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.46 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  37.23 
 
 		 913 aa  71.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.82 
 
 		 609 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  35 
 
 		 474 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  36.17 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.94 
 
 		 588 aa  69.3  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  31.45 
 
 		 699 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.86 
 
 		 847 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  42.55 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  43.37 
 
 		 1298 aa  68.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  38.38 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  25.54 
 
 		 880 aa  68.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  36.9 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  28.36 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.2 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  34.91 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  40.7 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  48.78 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 702 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  37.35 
 
 		 925 aa  67.4  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.73 
 
 		 984 aa  67.4  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  38.04 
 
 		 487 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  23.46 
 
 		 2042 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  26.01 
 
 		 794 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  26.29 
 
 		 1759 aa  66.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  36.17 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  36.17 
 
 		 906 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.71 
 
 		 743 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  24.31 
 
 		 715 aa  66.6  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>