163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0598 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 577 aa  1194    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  43.16 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 		 563 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  40.15 
 
 		 556 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.48 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  41.18 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  37.95 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  36.27 
 
 		 571 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  38.46 
 
 		 517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.29 
 
 		 538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.82 
 
 		 515 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.4 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  35.51 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  36.38 
 
 		 497 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  37.76 
 
 		 484 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  32.53 
 
 		 550 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.09 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  35.65 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.28 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.79 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 492 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.26 
 
 		 539 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 498 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.79 
 
 		 546 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.21 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.88 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 636 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 559 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  31.38 
 
 		 541 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.08 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31.38 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  38.99 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.9 
 
 		 497 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.73 
 
 		 541 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  38.29 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  31.95 
 
 		 526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  30.04 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  31.56 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.23 
 
 		 562 aa  193  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 540 aa  190  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  34.48 
 
 		 591 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  29.04 
 
 		 536 aa  183  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.26 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.1 
 
 		 551 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.7 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 		 572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 560 aa  163  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.24 
 
 		 527 aa  163  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  32.19 
 
 		 1338 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.35 
 
 		 558 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  30.8 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.66 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.36 
 
 		 525 aa  154  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  24.66 
 
 		 590 aa  143  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  26.24 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.16 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  26.74 
 
 		 746 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.93 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 534 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 518 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 665 aa  127  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.05 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 		 545 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 650 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23.54 
 
 		 500 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  33.45 
 
 		 365 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 1195 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 797 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  24.42 
 
 		 1585 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.85 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.95 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.13 
 
 		 1474 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  42.98 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.9 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  22.48 
 
 		 524 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.34 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  26.47 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>