38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0582 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  955    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  31.78 
 
 		 566 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  25.74 
 
 		 548 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  27.42 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  31.08 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  30.06 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  27.1 
 
 		 559 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  28.01 
 
 		 556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  29.75 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  29.01 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  27.9 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  29.24 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  27.1 
 
 		 558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  27.01 
 
 		 543 aa  117  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  30.15 
 
 		 484 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.27 
 
 		 454 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  28.06 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  27.81 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  24.38 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4741  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  24.17 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  24 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  37.4 
 
 		 238 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1113  hypothetical protein  28.22 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.21 
 
 		 954 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  25.36 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>