241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0555 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 214 aa  450  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.62 
 
 		 194 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60 
 
 		 192 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 187 aa  241  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.25 
 
 		 198 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.96 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 191 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 191 aa  237  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 190 aa  237  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.16 
 
 		 187 aa  236  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  64.09 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.54 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.85 
 
 		 208 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.62 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.54 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 194 aa  234  6e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.7 
 
 		 191 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.66 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.66 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.75 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.53 
 
 		 196 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.33 
 
 		 208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  62.98 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.14 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.87 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.7 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.76 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.92 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.38 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.22 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.84 
 
 		 209 aa  224  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  56.38 
 
 		 189 aa  224  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.75 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.38 
 
 		 188 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.22 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.84 
 
 		 191 aa  221  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.35 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  55.14 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.72 
 
 		 195 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.01 
 
 		 183 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  0.000000000590719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.08 
 
 		 183 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.59 
 
 		 193 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.48 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.8 
 
 		 223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.08 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 		 191 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0010  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.91 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.01 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00110  DNA-3-methyladenine glycosidase I  57.22 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.96 
 
 		 212 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.96 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.48 
 
 		 183 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0744  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 		 195 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.55 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2400  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.43 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.385566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0013  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.38 
 
 		 183 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.85 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  53.26 
 
 		 190 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6706  methyladenine glycosylase  55.85 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535788  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 183 aa  205  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.49 
 
 		 186 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6187  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  53.26 
 
 		 190 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.85 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  50.27 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  50.27 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.19 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.27 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  50.27 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0183  DNA-3-methyladenine glycosidase I  54.79 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  51.93 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.08 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  50.54 
 
 		 189 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 		 200 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 		 200 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.13 
 
 		 200 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 187 aa  198  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.85 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.54 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>