More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0519 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 1029 aa  2111    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 2539 aa  337  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1758 aa  333  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.67 
 
 		 2476 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 1832 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 2423 aa  324  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.98 
 
 		 1971 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.84 
 
 		 2336 aa  321  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.64 
 
 		 1992 aa  320  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.94 
 
 		 1987 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.95 
 
 		 2301 aa  307  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  33.33 
 
 		 2301 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 1725 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  28.26 
 
 		 2284 aa  305  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 1725 aa  303  8.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 2212 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1907 aa  295  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.86 
 
 		 1960 aa  293  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1647 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  28.69 
 
 		 2092 aa  292  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 1609 aa  291  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.8 
 
 		 1866 aa  290  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1646 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1646 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.25 
 
 		 1834 aa  290  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.82 
 
 		 1956 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 2012 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29.63 
 
 		 1643 aa  280  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 2026 aa  279  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.1 
 
 		 2048 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  29.26 
 
 		 2026 aa  277  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 952 aa  277  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 1127 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 1629 aa  277  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 2164 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  29.89 
 
 		 2070 aa  273  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 1736 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1012 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 2009 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1155 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.32 
 
 		 1983 aa  266  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  29.26 
 
 		 1989 aa  263  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 1078 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1098 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 2137 aa  261  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  29.15 
 
 		 1888 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1098 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 977 aa  260  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  29.54 
 
 		 1970 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  30.24 
 
 		 1020 aa  257  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.2 
 
 		 769 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.42 
 
 		 769 aa  255  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.49 
 
 		 2325 aa  255  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 2175 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  30.42 
 
 		 769 aa  254  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 928 aa  252  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 1137 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 1065 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 1125 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.57 
 
 		 1180 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 974 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1616 aa  244  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.04 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 742 aa  243  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  25.77 
 
 		 803 aa  240  8e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  28.75 
 
 		 783 aa  240  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.34 
 
 		 974 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 934 aa  239  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  28.47 
 
 		 785 aa  238  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.12 
 
 		 774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  28.21 
 
 		 770 aa  232  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 911 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 911 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 941 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 989 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 989 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 911 aa  224  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.66 
 
 		 789 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3244  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.8 
 
 		 1197 aa  223  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.11034  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.15 
 
 		 764 aa  221  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  26.93 
 
 		 734 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 756 aa  220  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 755 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  27.65 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  29.12 
 
 		 768 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 865 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 865 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  29.83 
 
 		 793 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 772 aa  212  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 756 aa  212  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  25.63 
 
 		 878 aa  211  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 783 aa  211  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 765 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.08 
 
 		 769 aa  210  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 686 aa  209  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 762 aa  208  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  31.55 
 
 		 764 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>