More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0518 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  100 
 
 
501 aa  1031    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
495 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.84 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.76 
 
 
466 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  31.25 
 
 
444 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.8 
 
 
444 aa  203  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.68 
 
 
474 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 
492 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  32.64 
 
 
545 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 
490 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.91 
 
 
480 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 
532 aa  193  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.37 
 
 
542 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.54 
 
 
448 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.97 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 
449 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.27 
 
 
448 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.39 
 
 
461 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.69 
 
 
476 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
461 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  32.84 
 
 
328 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4048  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 
476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
468 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.96 
 
 
474 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 
444 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.46 
 
 
463 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  28.99 
 
 
479 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.94 
 
 
461 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 
479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 
461 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.18 
 
 
451 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 
465 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 
445 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 
479 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 
464 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.15 
 
 
479 aa  147  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 
499 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  26.81 
 
 
458 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.34 
 
 
477 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.25 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.79 
 
 
465 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  28.42 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  29.24 
 
 
471 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.57 
 
 
705 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  27.71 
 
 
459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.03 
 
 
473 aa  136  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  29.11 
 
 
463 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 
477 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  27.44 
 
 
470 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
490 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  28.78 
 
 
462 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  28.63 
 
 
462 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.23 
 
 
473 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 
465 aa  127  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  28.45 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  27.54 
 
 
456 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.11 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.52 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.93 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  25.52 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  27.53 
 
 
460 aa  115  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  29.25 
 
 
479 aa  113  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.21 
 
 
563 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  27.74 
 
 
752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  28.84 
 
 
466 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
896 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
896 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
896 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.78 
 
 
775 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
891 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  32.26 
 
 
894 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.35 
 
 
726 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 
864 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 
614 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 
864 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 
449 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.88 
 
 
864 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.36 
 
 
574 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.09 
 
 
734 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  23.36 
 
 
491 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 
484 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  28.51 
 
 
465 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
758 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.33 
 
 
456 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  26.44 
 
 
602 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.95 
 
 
469 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  31.02 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  31 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.53 
 
 
448 aa  97.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07081  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 
574 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.206599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 
472 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  27.65 
 
 
461 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.06 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  29.41 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>