190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0515 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  100 
 
 		 1079 aa  2221    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  29.92 
 
 		 1057 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 		 1096 aa  299  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 1192 aa  177  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.61 
 
 		 1131 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 		 1188 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 1383 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1142 aa  97.8  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  22.84 
 
 		 1320 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 		 1160 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 973 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.01 
 
 		 1422 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.68 
 
 		 1429 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.15 
 
 		 1080 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 1422 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.8 
 
 		 1147 aa  89  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 1094 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 1340 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  24.31 
 
 		 1133 aa  85.5  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 1151 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 1151 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.4 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.09 
 
 		 1403 aa  81.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.81 
 
 		 1441 aa  81.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.74 
 
 		 1081 aa  81.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.05 
 
 		 1148 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  23.35 
 
 		 1289 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 954 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.15 
 
 		 1014 aa  79  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.84 
 
 		 967 aa  79  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  23.34 
 
 		 983 aa  78.2  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.55 
 
 		 1175 aa  78.2  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.84 
 
 		 1360 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 1400 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  24.33 
 
 		 1006 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  23.02 
 
 		 1005 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3719  hypothetical protein  48.1 
 
 		 108 aa  76.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 		 1105 aa  75.5  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 1321 aa  75.1  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.6 
 
 		 1295 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  24.27 
 
 		 916 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.26 
 
 		 1403 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.46 
 
 		 1271 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 		 1089 aa  72.4  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  25.78 
 
 		 1122 aa  72  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.36 
 
 		 1053 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  21.88 
 
 		 900 aa  70.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  25.43 
 
 		 1013 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 		 1139 aa  68.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.47 
 
 		 1291 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 881 aa  68.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  23.53 
 
 		 1075 aa  68.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 1217 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  22.52 
 
 		 1053 aa  67.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.63 
 
 		 1055 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  22.19 
 
 		 1071 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  24.08 
 
 		 1138 aa  67  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  23.87 
 
 		 1034 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 1346 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 1193 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  24.36 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  23.69 
 
 		 1134 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  21.6 
 
 		 1020 aa  65.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.67 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  21.79 
 
 		 1046 aa  65.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  22.52 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  22.34 
 
 		 1198 aa  65.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  22.03 
 
 		 919 aa  65.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  23.87 
 
 		 993 aa  64.7  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  22.9 
 
 		 1029 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  23.11 
 
 		 1055 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  23.47 
 
 		 956 aa  62.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  24.59 
 
 		 982 aa  63.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  23.01 
 
 		 1063 aa  62.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 1030 aa  62  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1227 aa  62  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1298 aa  61.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.98 
 
 		 1141 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 1015 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  22.11 
 
 		 1048 aa  61.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 		 1065 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  23.04 
 
 		 1377 aa  61.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.38 
 
 		 1149 aa  60.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 895 aa  60.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 1311 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  21.62 
 
 		 1710 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  22.36 
 
 		 1130 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  22.7 
 
 		 992 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  22.05 
 
 		 1013 aa  58.9  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  23.93 
 
 		 999 aa  58.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 1141 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  22.99 
 
 		 1090 aa  58.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 1402 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  23.7 
 
 		 1022 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.67 
 
 		 1666 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 921 aa  57  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  23.47 
 
 		 966 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 		 1043 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  22.81 
 
 		 1084 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>