More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0502 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1255  glutamine synthetase, type I  70.47 
 
 
471 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.027099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  65.1 
 
 
469 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5046  glutamine synthetase, type I  72.47 
 
 
468 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  74.35 
 
 
469 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  70.47 
 
 
471 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3916  glutamine synthetase  70.88 
 
 
469 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  64.81 
 
 
469 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0400  glutamine synthetase  71.79 
 
 
468 aa  716    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0641467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  68.01 
 
 
472 aa  697    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  65.44 
 
 
469 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4410  glutamine synthetase  71.46 
 
 
469 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0359  glutamine synthetase, type I  71.61 
 
 
468 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  69.4 
 
 
471 aa  705    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  66.38 
 
 
471 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1318  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1315  glutamine synthetase  63.79 
 
 
469 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4817  glutamine synthetase type I  72.9 
 
 
468 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0975  L-glutamine synthetase  68.02 
 
 
469 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.85428  hitchhiker  0.000890816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3763  L-glutamine synthetase  72.59 
 
 
471 aa  718    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.382156  normal  0.0833573 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1645  glutamine synthetase, type I  70.21 
 
 
469 aa  694    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.356376  normal  0.294461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  69.4 
 
 
471 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  73.61 
 
 
469 aa  741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0769  glutamine synthetase, type I  75.86 
 
 
467 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  73.28 
 
 
469 aa  723    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  66.52 
 
 
469 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  71.89 
 
 
469 aa  727    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  70.6 
 
 
469 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0344  L-glutamine synthetase  72.69 
 
 
468 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  68.53 
 
 
471 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  65.66 
 
 
469 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  69.38 
 
 
469 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0412  glutamine synthetase  71.67 
 
 
469 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0536  glutamine synthetase, type I  67.02 
 
 
468 aa  679    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.107536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  65.3 
 
 
471 aa  663    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4920  glutamine synthetase, type I  72.47 
 
 
468 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4140  L-glutamine synthetase  74.68 
 
 
468 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0418  glutamine synthetase, type I  73.12 
 
 
468 aa  721    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.910839  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2288  glutamine synthetase, type I  70.26 
 
 
469 aa  717    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  66.09 
 
 
469 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  67.03 
 
 
471 aa  670    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  65.44 
 
 
469 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  68.75 
 
 
471 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0311  glutamine synthetase  71.24 
 
 
469 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  65.24 
 
 
469 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  68.32 
 
 
471 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  73.06 
 
 
471 aa  726    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  69.38 
 
 
469 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  63.66 
 
 
469 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  68.75 
 
 
471 aa  689    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  100 
 
 
468 aa  976    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  65.67 
 
 
469 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  70.91 
 
 
469 aa  706    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  69.18 
 
 
471 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  69.18 
 
 
471 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3454  glutamine synthetase  70.6 
 
 
469 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00170098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2780  glutamine synthetase, type I  67.67 
 
 
471 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481689  hitchhiker  0.00799964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  65.67 
 
 
469 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  76.28 
 
 
469 aa  768    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  66.09 
 
 
469 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1440  glutamine synthetase, type I  67.8 
 
 
469 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00931108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  69.4 
 
 
471 aa  702    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  74.46 
 
 
471 aa  742    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5098  glutamine synthetase, type I  72.26 
 
 
468 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  66.38 
 
 
471 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  68.32 
 
 
471 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0306  glutamine synthetase  71.24 
 
 
469 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  73.18 
 
 
469 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  65.52 
 
 
469 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  70.45 
 
 
469 aa  710    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  71.09 
 
 
469 aa  717    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0305  glutamine synthetase  71.67 
 
 
469 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  71.67 
 
 
469 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  75.65 
 
 
471 aa  744    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0325  glutamine synthetase  70.6 
 
 
469 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000686666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0736  glutamine synthetase, type I  82.01 
 
 
468 aa  808    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00218328  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4643  glutamine synthetase  70.24 
 
 
469 aa  701    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  68.53 
 
 
471 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  75.27 
 
 
469 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  75.27 
 
 
469 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  68.32 
 
 
471 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  71.89 
 
 
469 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  71.89 
 
 
469 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0292  glutamine synthetase  70.02 
 
 
469 aa  703    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000978153 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0307  glutamine synthetase  71.24 
 
 
469 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  69.38 
 
 
469 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  71.67 
 
 
469 aa  724    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3484  glutamine synthetase, type I  69.07 
 
 
472 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  68.97 
 
 
471 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>