More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0470 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
382 aa  786    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  78.53 
 
 
387 aa  628  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  76.64 
 
 
389 aa  614  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 
396 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  76.86 
 
 
390 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  74.94 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  74.42 
 
 
396 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  73.89 
 
 
403 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  75.86 
 
 
385 aa  608  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  74.42 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  74.68 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  74.68 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0383  S-adenosylmethionine synthetase  75.52 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4794  S-adenosylmethionine synthetase  75.52 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  74.74 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  73.57 
 
 
406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  74.17 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  73.06 
 
 
395 aa  591  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  74.47 
 
 
381 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  71.54 
 
 
388 aa  584  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04686  S-adenosylmethionine synthetase  75.87 
 
 
403 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  71.54 
 
 
388 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  71.28 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  73.23 
 
 
383 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  72.75 
 
 
391 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  70.34 
 
 
393 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  72.7 
 
 
383 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  72.7 
 
 
383 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  70.08 
 
 
393 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0630  S-adenosylmethionine synthetase  74.8 
 
 
403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.370099  normal  0.156733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  72.97 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  72.97 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  72.97 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  72.7 
 
 
384 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  73.23 
 
 
383 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  72.44 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  71.92 
 
 
383 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  73.49 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  71.92 
 
 
384 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  71.92 
 
 
384 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  71.92 
 
 
384 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  69.6 
 
 
403 aa  568  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
383 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
384 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  70.08 
 
 
385 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  69.35 
 
 
403 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 
383 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  70.26 
 
 
382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  70.53 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  70 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  71.39 
 
 
383 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  71.13 
 
 
383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  71.81 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  71.73 
 
 
384 aa  559  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  71.2 
 
 
384 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  67.89 
 
 
388 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  70.76 
 
 
389 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  70.76 
 
 
389 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  69.19 
 
 
387 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  68.05 
 
 
390 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0024  S-adenosylmethionine synthetase  71.65 
 
 
385 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0549  S-adenosylmethionine synthetase  72.7 
 
 
384 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000243541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  68.93 
 
 
387 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1623  S-adenosylmethionine synthetase  71.65 
 
 
384 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  72.44 
 
 
384 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  69.15 
 
 
393 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  71.65 
 
 
406 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  71.47 
 
 
396 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  68.38 
 
 
393 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  71.39 
 
 
383 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  70.94 
 
 
396 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  70.68 
 
 
395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  71.47 
 
 
395 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  71.73 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002467  S-adenosylmethionine synthetase  71.13 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.508872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  71.73 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  68.15 
 
 
387 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  71.73 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  69.01 
 
 
393 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  70.94 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  70.94 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  70.94 
 
 
395 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0015  S-adenosylmethionine synthetase  67.45 
 
 
385 aa  535  1e-151  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>