205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0362 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0362  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 225 aa  456  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00749625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.59 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  29.52 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  27.69 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.69 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  30.33 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  26.67 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  24.76 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  26.27 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  26.67 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  26.27 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  26.27 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  26.27 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  27.43 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  26.27 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  29.03 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0205  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0183  glutathione S-transferase family protein  25.68 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0326305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  26.86 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  23.5 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  25.45 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.56 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.57 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  25.81 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  26.44 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  25.52 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  25.95 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  31.87 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.06 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.74 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.06 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  24.06 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  29.8 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  27.03 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  26.9 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1087  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.26 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  25.93 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.82 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.7 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.95 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  25.96 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  26.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.55 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  26.55 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.73 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  25.7 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.89 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.42 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.75 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  24.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  25.11 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  27.37 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  27.37 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0975  glutathione S-transferase-like protein  26.79 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  28.12 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  25.11 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  26.25 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2143  glutathione S-transferase-like protein  28.25 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  24.72 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  23.84 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  26.95 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  24.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  27.22 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0851  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.31 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  28.31 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2264  glutathione S-transferase-like protein  28.25 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.35 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.95 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  24.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  24.28 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  21 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  31.87 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.63 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.36 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  25.46 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  23.63 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  29.85 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  23.83 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  23.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  24.22 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  24.22 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  24.29 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  26.14 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  23.77 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  27.18 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>