75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0340 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  61.03 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  55.04 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  57.94 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  57.14 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  48.89 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  57.98 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  57.98 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  57.98 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  51.94 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  49.6 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  46.22 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  46.21 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  44.54 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.67 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  41.86 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  40.16 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  43.22 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  38.85 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  30.15 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  27.86 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  37.74 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  27.14 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.74 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  29.66 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  27.05 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  30.7 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  23.93 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  32.29 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  32.46 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  27.59 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  27.64 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  26.96 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  29.91 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  27.01 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  30.34 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  29.03 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  34.62 
 
 		 283 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  37.07 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  32.18 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  27.03 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  36.21 
 
 		 381 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0807  hypothetical protein  25.9 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  26.83 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.61 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  31.67 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  35.85 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.43 
 
 		 278 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  31.93 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  45.24 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  26.92 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  29.57 
 
 		 286 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  32.81 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  29.6 
 
 		 272 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.23 
 
 		 273 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>