More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0285 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  751    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  32.7 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  33.44 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.69 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  31.02 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  30.58 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  30.46 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  30.79 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  33.21 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  27.93 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  31.08 
 
 		 485 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 497 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  31.53 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  31.19 
 
 		 485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  32.53 
 
 		 481 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  31.08 
 
 		 485 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.54 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  31.79 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  30.46 
 
 		 481 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 479 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.42 
 
 		 487 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  29.62 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  47.79 
 
 		 620 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  28.77 
 
 		 487 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 		 466 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  28.28 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  44.95 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.12 
 
 		 890 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  49.49 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  48.54 
 
 		 215 aa  93.6  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  30.96 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  41.48 
 
 		 416 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  25.52 
 
 		 326 aa  93.2  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.22 
 
 		 417 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.18 
 
 		 694 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  46.3 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  46.3 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 630 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.19 
 
 		 422 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 537 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 468 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  27.24 
 
 		 310 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  48.48 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  44.34 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  41.51 
 
 		 640 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  50 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 215 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 169 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  27.44 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 432 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45 
 
 		 209 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  45.22 
 
 		 487 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  45 
 
 		 214 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  46 
 
 		 294 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 222 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 209 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 209 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.37 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  47 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.57 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  44.44 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  44.07 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.43 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  40.74 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.35 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.4 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>