More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0263 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  74.83 
 
 		 152 aa  230  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  73.43 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  57.34 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  55.17 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  53.64 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  47.92 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  50.33 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  43.54 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  54.86 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  47.18 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  47.18 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  45.77 
 
 		 148 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  48.55 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  49.28 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  44.9 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 139 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  48.12 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  41.43 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  42.66 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  48.48 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  44.2 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.25 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  34.44 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 167 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  45.11 
 
 		 181 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  39.44 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  41.01 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  40.29 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  40.58 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  37.32 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  44.27 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4452  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 155 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>