More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0162 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  28.86 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.77 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.41 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.47 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.61 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.03 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.9 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  25.83 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.65 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.82 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.72 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.13 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.07 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.15 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.13 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.8 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.13 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.13 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.5 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.64 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.13 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.88 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.17 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.13 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  26.13 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.87 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>