267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0157 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
402 aa  835    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  34.91 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
396 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
414 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
456 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
1340 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
405 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  30.32 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
429 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
376 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  25.6 
 
 
394 aa  109  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
406 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
392 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
407 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
400 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  32.63 
 
 
399 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
416 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.47 
 
 
413 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  25.13 
 
 
402 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
404 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.86 
 
 
413 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  24.68 
 
 
402 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
956 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
434 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
401 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
389 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
435 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
274 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
403 aa  99.8  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  37.72 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  30.67 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.22 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
535 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.83 
 
 
860 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  23.05 
 
 
442 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
415 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
411 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
387 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  25.45 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  27.98 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
436 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.38 
 
 
429 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.52 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  27.7 
 
 
402 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
1156 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
703 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.21 
 
 
700 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
1348 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  22.89 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  22.03 
 
 
1119 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  27.15 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
691 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
1106 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
691 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  35.45 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
994 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  24.6 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
902 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
691 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>