More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0145 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  860    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  36.3 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 403 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 274 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  27.29 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.3 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 421 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  23.69 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.98 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.13 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  23.54 
 
 		 397 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  24.46 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  25.37 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  23.8 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  25.21 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 994 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 956 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  25.55 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 1340 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.56 
 
 		 1119 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  25.58 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  22.63 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  28.22 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  22.93 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 1156 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.16 
 
 		 700 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 535 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  24.82 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 499 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  29.84 
 
 		 860 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  29.52 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 902 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 703 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  24.42 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  26.6 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  20.56 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  27.91 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  29.26 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  25.68 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>